2016年12月29日,国家知识产权局网站发布了《2016年度国家知识产权示范企业名单》，昆药集团股份有限公司获得“2016年度国家知识产权示范企业”认定，期限自2016年12月至2019年11月，这是继2014年公司获得企业知识产权管理体系首批认证后的又一殊荣。全国此次被确定为“2016年度国家知识产权示范企业”的企业共有101家（其中医药行业9家），云南省仅有2家（其中医药行业1家）。

2016年7月-2016年11月，在云南省知识产权局的指导和帮助下，在公司领导的重视和支持下，在公司各相关部门的协助和配合下，综合服务平台法律事务室顺利开展了国家知识产权示范企业申报工作。本次申报工作采用网上填报方式和纸质材料申报相结合的方式进行，在企业自主申报、省知识产权局专家评审和申报系统自动打分的基础上，由省知识产权局将符合条件的企业推荐至国家知识产权局，国家知识产权局再组织专家进行评审、答辩、通过后公示。

国家知识产权示范企业培育工作，旨在贯彻落实《国家知识产权战略纲要》和《全国专利事业发展战略（2011—2020年）》精神，加快形成一批拥有自主知识产权和知名品牌、国际竞争力较强的骨干企业。昆药集团此次入选国家知识示范企业是对公司知识产权工作和自主研发创新能力的肯定和鼓励，公司将继续不断完善知识产权管理体系，有效提升公司知识产权创造、运用、保护和管理能力，增强自主创新能力和市场竞争力，在我国医药行业领域发挥引领示范作用，逐步形成具有自主知识产权的支柱产业，全面增强企业核心竞争力。